1、提高土壤的培肥地力作用

土壤中的微量元素95%以不溶態形式存在，不能被植物吸收利用，而微生物代謝產物中含有大量的有機酸類物質。

這些物質就像在冰塊中加入的熱水一樣，很快就能把微量元素如鈣、鎂、硫、銅、鋅、鐵、硼、鉬等植物必需的礦物元素溶解，變成可以被植物直接吸收利用的營養元素，大大增加了土壤的供肥能力。

有機肥料中的有機質增加了土壤中的有機質含量，使得土壤粘結度降低，砂性土壤保水保肥性能變強，從而土壤形成穩定的團粒結構，便可以發揮良好的肥力協調供應能力。

2、增強農作物抗病、抗旱、耐澇能力

有機肥含有維生素、抗生素等，可增強農作物抗性，減輕或防止病害發生。有機肥施入土壤后，可增強土壤的蓄水保水能力，在干旱情況下，能增強作物的抗旱能力。

同時，有機肥還可使土壤變得疏松，改善作物根系的生態環境，促進根系的生長，增強根系活力，提高作物耐澇能力，減少植物的死亡率，提高了農產品的生存率。

3、提高食品的安全性、綠色性

國家早已明文規定，農業生產過程必須限制無機肥料的過量使用，有機肥料才是生產綠色食品的主要肥源。

由于有機肥料中各種營養元素比較完全，而且這些物質完全是無毒、無害、無污染的自然物質，這就為生產高產、優質、無污染的綠色食品提供了必須條件。前面說的腐殖酸物質，可以減輕重金屬離子對植物的危害，也就相當于減少了重金屬對人體的危害。

4、提高農作物產量

有機肥中的有益微生物利用土壤中的有機質，產生次級代謝物，其中含有大量的促生長類物質。

如生長素，能促進植物伸長生長，脫落酸能促進果實成熟，赤霉素能促進開花坐果，增加開花數、保果率，提高產量，使果實飽滿，色澤鮮嫩，還能提早上市，達到增產增收。

5、促進土壤微生物繁殖

有機肥料可以使土壤中的微生物大量繁殖，特別是許多有益的微生物，如固氮菌、氨化菌、纖維素分解菌等。這些有益微生物，能分解土壤中的有機物，增加土壤的團粒結構，改善土壤組成。

有機肥中的有益微生物能抑制有害病菌的繁殖，這樣就可以做到“少打藥”，如果連續多年施用，可有效抑制土壤有害生物。